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这是一维码(条形码)。
这是微信二维码。
这是“三维码”。
StripeSpotter的图像辨别|参考资料[4]
没搞错,这个“三维码”是细纹斑马(Equus grevyi)身上的图案。细纹斑马分布在非洲的肯尼亚和埃塞俄比亚,是所有野生马科动物中是体型最大的。然而,为了获得细纹斑马的皮毛,盗猎者对细纹斑马大肆猎杀。再加上栖息地的丧失,现在野生细纹斑马的数目仅剩约2800头,已经被列为濒危物种。
细纹斑马比其他斑马更高,耳朵更大,斑纹更狭窄|Wikipedia
为了更好地保护这类斑马,几位科学家历经波折,最后灵光乍现:请出人工智能来给斑马们“扫描二维码”吧。
如何进行“马口普查”?
塔妮娅·伯杰-沃尔夫(Tanya Berger-Wolf)博士目前是俄亥俄州立大学转化数据剖析研究所所长,她也是计算生态学(computational ecologist)最早的研究职员之一。她最开始的想法非常简单:保护细纹斑马。
伯杰-沃尔夫攻读的是计算机科学学位,不过在本科期间,她还担任了生态系的研究助理。计算机范围的很多数据与现实日常濒危物种数目的反差,给她留下了深刻的印象。在马上博士毕业的时候,她被细纹斑马深深地吸引了。
我们的计算机技能,能否帮助到保护濒危物种的工作呢?
在与生态学家的交流中,她发现给斑马“计数”是个难题。生态学家一直想推进肯尼亚推出保护细纹斑马的有关政策,但当地政府考虑到可能出现的抵制情绪,需要生态学家们可以对斑马数目进行准确的普查。
马口普查难|Wikimedia commons
当时,给野生动物计数并没什么一流的办法。要不把斑马抓来涂上标记,要不就是麻醉斑马给它们植入跟踪设施。但这类方法又贵又浪费时间,而且给斑马植入设施会出现创口,让斑马面临感染的风险。
由于“扫描二维码”,诞生了新学科
剩下的还有一种笨方法:拍照,然后人工比对斑马身上的条纹。这让伯杰-沃尔夫想到了新的办法:扫描二维码。
就像人的指纹一样,斑马身上的条纹也是与众不同的。生态学家拍照后进行人工比对,但图像辨别可以让这一过程智能化。
伯杰-沃尔夫和她的学生在这条路上探索,不久后,一个名为StripeSpotter的机器学习算法问世了。科学家可以将手中的相机变成扫描二维码器,仅需拍摄一张斑马的图片,并在电脑上运行该算法。算法读取图像后会提取图像中的特点并与数据库中的信息进行匹配,从而确认以前是不是已经标记过该动物。
就像超市里用扫描仪扫描条形码一样|图虫创意
这种图像辨别虽然听起来简单,但因为不同照片的光线、角度、地方都有非常大差别,即便是同一匹斑马在图像中看着也会差别非常大。因此,在练习该算法时,研究职员用了数千张斑马照片来获得一个稳定的匹配模式。
既然可以通过斑马的条纹来完成“扫描二维码”,那对于其他有花纹的动物,是否也可以用类似的办法?
公民科学带来的新将来
2013年,伯杰-沃尔夫与合作者发布了新的算法:HotSpotter。这套算法不仅能够用于斑马的辨别,更进一步应用到长颈鹿、豹子和狮子鱼等生物数据库的打造。
HotSpotter发布后,伯杰-沃尔夫还与肯尼亚政府进一步交流,将这套算法运用到实质中,完成了一次当地前所未有些斑马数据调查工作。在随后的几年里,这批数据的准确性不断被验证。
从理论上来看,这个算法还能拓展到更多的物种辨别上,但伯杰-沃尔夫缺少一个重点的组成部分:一个强大的数据管理软件。
一次偶然的相遇让她找到知道决方法。
就在伯杰-沃尔夫试想“扫描二维码”来计算斑马数目的时候,另一位物理学家扎文·阿祖马尼安(Zaven Arzoumanian)被鲸鲨强烈吸引了。
张开大嘴的鲸鲨|图虫创意
虽然鲸鲨是世界上现存体型最大的鱼类,但大家对它知之甚少。阿祖马尼安和他的技术员伙伴杰森·霍尔姆伯格(Jason Holmberg)也设计了一个辨别鲸鲨的算法,还联系了鲸鲨生物学家发起全球号召——让全世界的业余鲸鲨察看者通过互联网上传照片,算法可以在几秒内辨别出单个鲸鲨。
从8000多民公民科学家上传的照片与抓取YouTube视频中,研究职员在75000多起目击事件里辨别出了12000多条鲸鲨。这类数据让世界自然保护网盟的濒危物种红色名录将鲸鲨重新分类为濒危,并确定其数目趋势正在降低,而不是之前觉得的稳定。
在鲸鲨上获得初步成功后,阿祖马尼安和霍尔姆伯格想继续拓展。但,他们的算法不够给力,不过有完备的数据管理软件——这也是伯杰-沃尔夫缺少的。
三者通力合作,用HotSpotter取代原有些算法,借助现有些数据管理软件,开始了一个野心勃勃的项目——打造Wildbook,就是动物版本的Facebook。将野生动物研究、公民科学和计算机视觉相结合,最后目的是可以辨别地球上动物物种的个体。如此的话,鲸鲨和斑马,还有许很多多的动物,都不是一个模糊的名字,而是一个有过去和将来、充满故事的个体。
Wildbook借助AI来区别动物个体的独特特点,比如鲸鱼尾巴的曲率|Wildme
Wildbook的一个资助者是Microsoft的“地球AI计划”(人工智能 for Earth)。Microsoft通过这个项目投资了5000万USD,来支持人工智能技术解决环境问题的倡议。这项计划的监督者乔什·亨雷蒂格(Josh Henretig)说:“迄今为止,科学家们只发现了大约150万个物种,而据估计地球上存在的物种总数可能高达1000万。这150万个物种里,只有不到5%被详细剖析过。有的物种正在从大家的星球上消失,而大家甚至一直都不了解。”
人工智能能帮人类做的,不仅仅是写邮件、画画,当当大家的个人秘书。比尔·盖茨曾表示,人工智能将帮助消除很多范围的不平等,包含教育、医疗和气候变化等。造福人类社会、保护大家赖以存活的地球,这是人工智能向善进步的方向。
参考文献
[1]Grevy's Zebra. https://www.awf.org/wildlife-conservation/grevys-zebra
[2] https://nautil.us/how-ai-can-save-the-zebras-530362/
[3] Saving Wildlife with Vacation Photos, thanks to 人工智能.https://www.mouser.com/empowering-innovation/artificial-intelligence/lifesciences
[4]M. Lahiri, C. Tantipathananandh, R. Warungu, D.I. Rubenstein, T.Y. Berger-Wolf. Biometric Animal Databases from Field Photographs: Identification of Individual Zebra in the Wild. Proceedings of the ACM International Conference on Multimedia Retrieval (ICMR 2011), Trento, Italy, 2011.
[5] Imageomics – A New Field of Science at the Crossroads of Biology and Machine Learning. https://www.nationalacademies.org/event/12-07-2022/imageomics-a-new-field-of-science-at-the-crossroads-of-biology-and-machine-learning
编辑:黄线狭鳕
本文来自果壳自然(ID:GuokrNature)
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